先の記事をあげたところ、「地中を進んだ可能性」のご指摘を受け、再計算してみました。

まず、出発点を変更します。

作品で描かれている雰囲気から、主な舞台となる学校を奥多摩と仮定し、出発点を奥多摩駅からとします。

次に、目的地も空港では無く、ヤンキースタジアムのあるブロンクスとします。

奥多摩駅は、
北緯35度48分33.2秒
東経139度5分48秒

ブロンクスは、
北緯40度42分15秒
西経73度55分05秒

2点間の距離は、先の10,851kmから、10,939kmに変更となります。
この場合のマッハ20での片道に要する時間はしかし、約27分でほぼ同じです。

この2点間を、地球内部を直線で結んだ場合の距離は、9,647kmとなり、1,204kmと、かなりのショートカットになります。
マッハ20での所要時間は、約23.6分となります。
往復7分ほど短縮されました(笑)

なお、抵抗などはすべて無視していますが、Twitterでのご指摘の経緯などは「『暗殺教室』殺せんせーの東京〜ニューヨーク往復にかかる推定時間」まとめ
に掲載しています。
ご指摘、ご教示頂いたみなさま、ありがとうございました。

2点間の距離及び地球内部距離の計算には、よしだはじめ様の制作したExcel関数を使用しました。御礼申し上げます。